Casi un cuarto de los empleados en el sector farmacéutico alemán trabajan en Baden-Württemberg. Empresas líderes alemanas en la industria farmacéutica como, p. ej., Altana, Ratiopharm y Boehringer Ingelheim tienen aquí su emplazamiento al igual que gigantes del sector extranjeros - p. ej., los dos consorcios farmacéuticos mundialmente más grandes Pfizer y GlaxoSmtihKline, así como Roche y Baxter. Además, con la empresa pharmexx se encuentra establecida en la región el mayor proveedor de servicios farmacéuticos alemán y una de las empresas de mayor crecimiento de Europa.
Dentro del sector de los remedios naturalistas se encuentran en Baden-Württemberg empresas como Schwabe, DHU, HEEL y ratiopharm. Además existe una variedad de pequeñas empresas, algunas de ellas altamente especializadas, que tienen su emplazamiento en Baden-Württemberg.