Fast ein Viertel der in der deutschen Pharmabranche Beschäftigten arbeiten in Baden-Württemberg. Führende deutsche Unternehmen der pharmazeutischen Industrie wie z.B. Altana, Ratiopharm und Boehringer Ingelheim haben ihre Standorte hier ebenso wie ausländische Branchenriesen - z.B. die beiden weltweit größten Pharmakonzerne Pfizer und GlaxoSmtihKline sowie Roche und Baxter. Mit pharmexx ist außerdem der größte deutsche Pharma-Dienstleister und eines der wachstumsstärksten Unternehmen Europas im Land beheimatet.
Aus der Naturheilmittel-Branche finden sich in Baden-Württemberg Firmen wie Schwabe, DHU, HEEL und ratiopharm. Daneben gibt es eine Vielzahl kleinerer, teilweise hochspezialisierter Unternehmen, die ihren Standort in Baden-Württemberg haben.